第二章 新药发现中的化学信息学和生物信息学

分子相似性搜索

1、单选题:
‎关于“谷本系数”的说法错误的是‏
选项:
A: 用于比较两个对应实体的相似度
B: 值越大,说明两个实体的相似度越高
C: 数值介于0到1之间
D: 化学相似性的计算是基于定量描述符
答案: 【 化学相似性的计算是基于定量描述符

2、多选题:
​新药研发中,运用分子相似性搜索可以‎
选项:
A: 寻找活性化合物
B: 临床研究
C: 预测分子靶点
D: 优化先导化合物
答案: 【 寻找活性化合物;
预测分子靶点;
优化先导化合物

3、判断题:
‎结构相似的分子一定具有相似的生物活性。‏
选项:
A: 正确
B: 错误
答案: 【 错误

4、判断题:
​分子相似性搜索是基于相似性规律进行的‌
选项:
A: 正确
B: 错误
答案: 【 正确

化学小分子的处理

1、单选题:
‏只适用于化学小分子的文件存储格式为:​
选项:
A: mol2
B: mol
C: PDF
D: pdb
答案: 【 mol

2、多选题:
​关于化学分子结构的编码说法正确的是:‌
选项:
A: 实现化学文件在计算机中进行存储和检索的基础
B: 具有唯一性
C: 具有无二义性
D: 根据编码原则和方法不同,现行有多种编码方法
答案: 【 实现化学文件在计算机中进行存储和检索的基础;
具有唯一性;
具有无二义性;
根据编码原则和方法不同,现行有多种编码方法

3、多选题:
‏化学分子的3D结构通常采用的哪些表示方法‏
选项:
A: 线性码
B: 文本串
C: 直角坐标法
D: 内坐标法
答案: 【 直角坐标法;
内坐标法

4、多选题:
‎关于分子表面的说法正确的是‌
选项:
A: 通过对电子分布的着色,分子的表面能过表达分子的不同性质
B: 范德华表面是对分子表面的最简单表征
C: 溶剂可及表面是从探针分子的角度定义分子表面
D: 范德华表面可能引起死体积
答案: 【 通过对电子分布的着色,分子的表面能过表达分子的不同性质;
范德华表面是对分子表面的最简单表征;
溶剂可及表面是从探针分子的角度定义分子表面;
范德华表面可能引起死体积

新药发现中的化学信息学和生物信息学

1、单选题:
‎药物研究中应用化学信息学不能够解决的问题的有:​
选项:
A: 性质/结构预测
B: 计算机辅助药物设计
C: 计算机辅助合成设计
D: 蛋白质结构的预测
答案: 【 蛋白质结构的预测

2、单选题:
‍只适用于化学小分子的文件存储格式为:‌
选项:
A: mol2
B: mol
C: pdb
D: pdf
答案: 【 mol

3、单选题:
‌关于化学分子结构的编码说法错误的是:‏
选项:
A: 是实现化学文件在计算机中进行存储和检索的基础
B: 具有唯一性
C: 具有无二义性
D: 根据编码原则和方法,现行仅有一种编码方法
答案: 【 根据编码原则和方法,现行仅有一种编码方法

4、单选题:
‍关于分子表面的说法错误的是‌
选项:
A: 通过对电子分布的着色,分子的表面能过表达分子的不同性质
B: 范德华表面是对分子表面的最简单表征
C: 溶剂可及表面是从探针分子的角度定义分子表面
D: 溶剂可及表面可能引起死体积
答案: 【 溶剂可及表面可能引起死体积

5、单选题:
‏关于“谷本系数”的说法错误的是‎
选项:
A: 用于比较两个对应实体的相似度
B: 值越大,说明两个实体的相似度越高
C: 数值介于0到1之间
D: 化学相似性的计算是基于定量描述符
答案: 【 化学相似性的计算是基于定量描述符

6、单选题:
​新药研发中,不能通过分子相似性搜索达到的目的是‎
选项:
A: 寻找活性化合物
B: 临床研究
C: 预测分子靶点
D: 优化先导化合物
答案: 【 临床研究

7、单选题:
​将目标序列与结构数据库中的数据匹配,若序列同源性在30%以上,蛋白质模建采用的方法是‌
选项:
A: 同源模建
B: 折叠类型识别
C: 从头预测
D: 相似性搜索
答案: 【 同源模建

8、单选题:
‌蛋白质结构数据库的网址是‌
选项:
A: www.rcsb.org/pdb
B: www.cnki.net
C: www.organic-chemistry.org
D: http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
答案: 【 www.rcsb.org/pdb

9、多选题:
‏关于数据挖掘的说法正确的是:‌
选项:
A: 也称为知识发现
B: 目的是发现隐藏的、反映事物本质和预测事物发展趋势的有用知识和规律
C: 目前,数据挖掘已经在药物研究中发挥了巨大作用
D: 无论运用哪种方法进行数据挖掘,都会得到相同的结果。
答案: 【 也称为知识发现;
目的是发现隐藏的、反映事物本质和预测事物发展趋势的有用知识和规律;
目前,数据挖掘已经在药物研究中发挥了巨大作用

10、多选题:
​新药研发的主要难点是:‌
选项:
A: 与疾病相关的靶点生物大分子的识别
B: 具有特定功能的活性分子的设计和发现
C: 疾病靶点的确证
D: 药品上市之前的临床研究
答案: 【 与疾病相关的靶点生物大分子的识别;
具有特定功能的活性分子的设计和发现;
疾病靶点的确证

11、多选题:
‍化学信息学主要应用于药物研究中的哪些阶段‏
选项:
A: 靶点的识别
B: 靶点的确证
C: 先导化合物的发现
D: 先导化合物的优化
答案: 【 先导化合物的发现;
先导化合物的优化

12、多选题:
‌药物研究中利用生物信息学可以实现的是​
选项:
A: 靶点的识别
B: 靶点的确证
C: 先导化合物的发现
D: 先导化合物的优化
答案: 【 靶点的识别;
靶点的确证

13、多选题:
‏化学分子的3D结构通常采用的哪些表示方法‏
选项:
A: 线性码
B: 文本串
C: 直角坐标法
D: 内坐标法
答案: 【 直角坐标法;
内坐标法

14、多选题:
‎国内的硕博士论文可以在哪里查阅?‌
选项:
A: 知网www.cnki.net
B: 维普http://www.cqvip.com/
C: 万方http://c.wanfangdata.com.cn/periodical
D: http://www.sinomed.ac.cn/中国中医药数据库检索系统
答案: 【 知网www.cnki.net;
维普http://www.cqvip.com/;
万方http://c.wanfangdata.com.cn/periodical;
http://www.sinomed.ac.cn/中国中医药数据库检索系统

15、判断题:
‎当前生物信息学和化学信息学的难题之一是如何从大量实验数据中快速、准确地获取有指导价值的信息。‎
选项:
A: 正确
B: 错误
答案: 【 正确

16、判断题:
‌结构相似的分子一定具有相似的生物活性。​
选项:
A: 正确
B: 错误
答案: 【 错误

17、判断题:
‍常用的确定蛋白质功能的方法就是对数据库的序列信息进行相似性搜索。‏
选项:
A: 正确
B: 错误
答案: 【 正确

18、判断题:
​对

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